Κορυφαίο πρωτάθλημα είναι η Α΄ κατηγορία ποδοσφαίρου ανδρών Κύπρου, στην οποία συμμετέχουν 14 ομάδες. Ακολουθούν, κατά επίπεδο, η Β΄ κατηγορία ποδοσφαίρου ανδρών Κύπρου, η Γ΄ κατηγορία ποδοσφαίρου ανδρών Κύπρου και η Δ΄ κατηγορία ποδοσφαίρου ανδρών Κύπρου, στις οποίες συμμετέχουν 14 ομάδες ανά κατηγορία.

Ακολουθούν τα αγροτικά πρωταθλήματα τα οποία ελέγχονται από τη ΣΤΟΚ. Κάθε πρωτάθλημα αφορά μια γεωγραφική περιοχή και μπορεί να χωρίζεται σε επιμέρους κατηγορίες.

Κάθε πρωτάθλημα καθορίζει τους δικούς του κανόνες, αλλά σε όλα τα πρωταθλήματα κάθε ομάδα αναμετριέται με όλες τις υπόλοιπες με τη νίκη να επιβραβεύεται με 3 βαθμούς, η ισοπαλία με 1 και η ήττα με 0. Στον πίνακα βαθμολογίας οι ομάδες κατατάσσονται με βάση τους βαθμούς που συγκεντρώνουν (πρώτη η ομάδα με τους περισσότερους βαθμούς και τελευταία η ομάδα με τους λιγότερους). Σε περίπτωση ισοβαθμιών, κάθε πρωτάθλημα καθορίζει τους δικού του κανόνες.

Στο τέλος κάθε ποδοσφαιρικής περιόδου, οι τρεις πρώτες ομάδες κάθε πρωταθλήματος προβιβάζονται σε ανώτερη κατηγορία και οι τρεις τελευταίες υποβιβάζονται σε χαμηλότερη κατηγορία. Ο προβιβασμός στη Δ΄ κατηγορία προκύπτει από τους αγώνες ένταξης που διοργανώνει η ΣΤΟΚ.